آنالیز پروفایل nbs (nucleotide binding-site) ژنهای مقاومت به بیماری در ارقام مختلف زیتون

پایان نامه
چکیده

به منظور مطالعه ژنهای مقاومت nbs-lrr و تنوع ژنتیکی آنها در بین ارقام بومی زیتون و همچنین مقایسه آن با ارقام خارجی، از تکنیک profiling nbs و آنالیزهای مولکولی استفاده شد. برای این منظور dna ژنومی تعداد 5 رقم خارجی و 5 رقم داخلی زیتون استخراج و با آنزیم های برشی alui و rsai هضم و با استفاده از 3 آغازگر دژنره( nbs2،nbs7،nbs5a) در دو مرحله تکثیر شدند و الگوی باندی حاصل از تکثیر انتخابی آنها در روی ژل متافور آگارز 2 درصد مورد بررسی قرار گرفت. تعداد کل باندهای تکثیرشده 660 باند بوده که از این تعداد حدود 51 باند بین ارقام پلی مورفیسم نشان داد. بیشترین باند پلی مورفیسم از ترکیب nbs2/alui و کمترین باند پلی مورفیسم نیز از ترکیب nbs5a/alui حاصل شد. نتایج حاصل از آنالیز واریانس ملکولی(amova) نشان داد که بخش اعظم تنوع ژنتیکی به تنوع درون گروهی (78 درصد) و بخشی نیز به تنوع میان گروهی (22درصد) اختصاص دارد. براساس نتایج آنالیز خوشه ای، ارقام ایرانی و خارجی در سه خوشه قرار گرفتند و ارقام ایرانی از ارقام خارجی متمایز شدند. نتایج حاصل از داده های مولکولی توصیفی نیز نشان داد که مارکرهای nbsقدرت تفکیک مناسبی برای تعیین الگوهای باندی مربوط به ژنهای مقاومت دارند. نتایج این بررسی نشان داد که تنوع قابل ملاحظه در بین ارقام زیتون در خصوص ژن های مقاومت گروه nbs-lrr وجود دارد که می توان از آنها در مدیریت بیماری های زیتون و کشاورزی پایدار استفاده کرد. کلمات کلیدی: زیتون، ژنهای مقاومت به بیماری (nbs-lrr)، تکنیک nbs profiling

منابع مشابه

Plant Nucleotide Binding Site–Leucine-Rich Repeat (NBS-LRR) Genes: Active Guardians in Host Defense Responses

The most represented group of resistance genes are those of the nucleotide binding site-leucine-rich repeat (NBS-LRR) class. These genes are very numerous in the plant genome, and they often occur in clusters at specific loci following gene duplication and amplification events. To date, hundreds of resistance genes and relatively few quantitative trait loci for plant resistance to pathogens have ...

متن کامل

A Primary Survey on Bryophyte Species Reveals Two Novel Classes of Nucleotide-Binding Site (NBS) Genes

Due to their potential roles in pathogen defense, genes encoding nucleotide-binding site (NBS) domain have been particularly surveyed in many angiosperm genomes. Two typical classes were found: one is the TIR-NBS-LRR (TNL) class and the other is the CC-NBS-LRR (CNL) class. It is seldom known, however, what kind of NBS-encoding genes are mainly present in other plant groups, especially the most ...

متن کامل

بررسی مقاومت ارقام مختلف کاهو نسبت به بیماری پژمردگی فوزاریومی

بیماری پژمردگی فوزایومی کاهو که ناشی از قارچ Fusarium oxysporum f.sp.lactucum می باشد یکی از بیماری های مهم در منطقه ورامین کرج و شهر ری می باشد.نظر به اهمیت بیماری آزمایشهای مزرعه ای و گلخانهای به منظور ارزیابی حساسیت و مقاومت 15 رقم کاهو با نام های Summer Green Mignonette All Year Marul Bas Salata Bibb Ice.berg سیاه سوری سفید شهر ری کرجی دزفولی مراغه و سیاه محلی مشهد نسبت به قارچ عامل بیماری ...

متن کامل

cloning of three nucleotide-binding site leucine-rich repeat (nbs-lrr) class resistance gene analogs in pistacia khinjuk

pistacia khinjuk (stocks) is a native species that, along with p. atlantica, is widely distributed from eastern to western iran through the makran zone, zagros mountains and the sanandaj-sirjan zone, ranging from 50 to 3300 m above sea level. the identification of resistance gene analogs holds great promise for developing resistant plants. a pcr approach with degenerate primers designed from co...

متن کامل

Isolation of a family of resistance gene analogue sequences of the nucleotide binding site (NBS) type from Lens species.

Most known plant disease-resistance genes (R genes) include in their encoded products domains such as a nucleotide-binding site (NBS) or leucine-rich repeats (LRRs). Sequences with unknown function, but encoding these conserved domains, have been defined as resistance gene analogues (RGAs). The conserved motifs within plant NBS domains make it possible to use degenerate primers and PCR to isola...

متن کامل

بررسی مقاومت ارقام مختلف کاهو نسبت به بیماری پژمردگی فوزاریومی

بیماری پژمردگی فوزایومی کاهو که ناشی از قارچ fusarium oxysporum f.sp.lactucum می باشد یکی از بیماری های مهم در منطقه ورامین کرج و شهر ری می باشد.نظر به اهمیت بیماری آزمایشهای مزرعه ای و گلخانهای به منظور ارزیابی حساسیت و مقاومت 15 رقم کاهو با نام های summer green mignonette all year marul bas salata bibb ice.berg سیاه سوری سفید شهر ری کرجی دزفولی مراغه و سیاه محلی مشهد نسبت به قارچ عامل بیماری ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه زنجان - دانشکده کشاورزی زنجان

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023